近年来，瓜州县坚持建管并重，从规范建设流程、健全管护机制、补齐林网短板三个方面入手，不断完善高标准农田全流程管理制度体系，确保项目建得好、管得住、长久用。
一是规范设计联审，筑牢质量根基。制定印发《瓜州县高标准农田项目初步设计联审办法》，建立县乡村三级联审机制，在设计初审阶段充分征求水务、自然资源、林草、文物、生态环境等部门及乡镇、村组、农户意见，充分尊重群众意愿，实现项目设计科学性、实用性、可操作性相统一。
二是健全管护机制，保障长期效益。按照“谁受益、谁管护”原则，修订印发《瓜州县高标准农田建后管护实施细则》，明确县农业农村局建设责任、乡镇监督责任和村组管护责任，规范工程验收与移交流程，县财政保障管护资金。同时，将工程管护制度纳入村规民约，加强宣传引导，增强群众群管群护意识，营造爱护设施的良好氛围。
三是攻坚林网短板，稳固生态效能。针对防护林成活率不高等问题，出台《瓜州县2019—2024年度高标准农田防护林建设管护方案》，督促各乡镇和施工单位全面完成历年栽植及补植补栽任务，及时移交乡镇管护。县财政每年保障防护林管护费，确保农田防护林成活率、保存率达到设计要求，充分发挥生态防护效益。